Genetik und Evolution von Coronaviren

Qualifikationsphase
Inhaltsfeld: Genetik und Evolution

Dieses online-Angebot veranschaulicht, wie unter Verwendung bioinformatischer Software das Coronavirus SARS-CoV-2 genetisch und phylogenetisch analysiert werden kann. Sequenzvergleiche oder Stammbaumanalysen helfen dabei zum Beispiel bei der Analyse, wie sich die Varianten Alpha, Delta oder Omikron von dem Ursprungsvirus unterscheiden oder wann, wo und woraus das neuartige Coronavirus entstand. Dabei verwenden die Schüler*innen die phylogenetische Software MEGA (Moleculary Evolutionary Genetics Analysis).

Auch die Virusdiagnostik ist Thema des Workshops. Die Schüler*innen designen geeignete Primer und Gensonden für eine diagnostische „Endpunkt-PCR“ und eine real time PCR. Die „Endpunkt-PCR“ mit anschließender DNA-Gelelektrophorese führen die Schüler*innen auch selbstständig durch. Die real time PCR erarbeiten sich die Schüler*innen theoretisch.

Das hier bereitgestellte interaktive Skript mit multimedialen Lerninteraktionen bereitet die Schüler*innen auf den Kurstag vor.


Dieses sollte vor dem Kurstag durchgearbeitet werden.

Die genetischen und phylogenetischen Analysen mit dem Programm MEGA wurden während der Covid-19-Pandemie als Online-Kurs angeboten.

Dieser Kurs erhielt 2022 vom Dachverband der deutschen Schülerlabore LernortLabor eine Auszeichnung in der Kategorie Experiment des Jahres (1. Platz).

Das „Preisvideo“ rechts gibt einen kleinen Einblick in die Arbeiten mit dem Programm.